آنزیم پکتین‌متیل‌استراز آنزیمی است که پیوندهای اسری پکتین متیل استر را هیدرولیز و ایسدپکتیک و متانول تولید میکند و با تجزیه-ی پکتین، موجب شفاف سازی آب میوه می‌شود. پکتین، پلی ساکاریدی است که در تمام میوه ها و سبزیجات موجود است و ماده اصلی تشکیل دهنده پوسته میوه و دیواره سلولی است.